上海顯微鏡適用于學校教學、醫院教學、家庭教育、個人專業興趣等，常用于醫學上三大常規檢查，病理、細菌、組織學科實驗室研究所；也用于工業生產上細小物體的檢測，比如纖維、顆粒、光纖接頭、外形輪廓等。儀器還有專門用于外置攝影通道，選配攝像系統，可方便將圖像輸出至計算機進行拍照、分析和保存。
 

　　上海顯微鏡的使用方法：
 

　　1.電源插頭插入220V50Hz的插座，打開儀器基座后側的電源開關。基座側面調光手輪，使儀器的透射光連續可調。
 

　　2.裝上10X物鏡，從目鏡管中觀察并調整位于工作臺下的聚光鏡孔徑光闌，使孔徑光闌光斑的大小與物鏡后端的通光口徑相同。
 

　　3.將標本放在移動工作臺上，用標本夾夾緊。
 

　　4.裝上10X目鏡，通過目鏡觀察，調節粗微動調焦手輪使目鏡成像清晰。
 

　　5.當轉換到其他倍率物鏡時，視場中仍有輪廓成像，微調調焦手輪使之成像清晰。
 

　　6.調節孔徑光闌，使成像得到更好的對比度。上海顯微鏡高倍物鏡(40X和100X)為彈簧加載設計，可避免物鏡與標本因調焦不當相碰而損壞，但使用仍應避免兩者相碰。調焦過程中，用粗動調焦使工作臺快速上升，將接近標本時，用微動調焦，并兼顧視場及物鏡與標本的碰撞，緩慢地把像調清晰。為彌補空氣媒介對高倍率的吸收，使用100X油浸物鏡時，須在標本片表面滴上一小滴浸油，使物鏡與標本間形成浸油增透，使用完畢即用二甲苯或混合液擦拭干凈，以免日久合成浸油凝固而不易清除，影響使用。移動工作臺縱橫均有刻尺，操作時可確定標本的移動量。工作臺下的聚光鏡座還裝有濾色片托架，平移托架，放入濾色片，以適應不同的標本及效果。